按照人社部发〔2012〕69号文件的规定精神，事业单位工作人员和机关工人退休后被判处有期徒刑（不含被宣告缓刑的）以上刑罚的，从人民法院判决生效之日起，取消原退休费待遇。刑罚执行完毕后的生活待遇，由原发给退休费的单位酌情处理。
这里有一个由原单位酌情处理的问题，基本生活费可能还有有一点，但这是出于人道主义的安排，是一种补助性质的，实际上这只是在机关事业单位养老保险制度实施之前的一种做法。在机关事业单位养老保险制度实施以后，由于退休人员的基本养老金全部是由社保部门来计发的，原单位可能没有办法再酌情考虑生活费了。
按照69号文件的规定，事业单位工作人员和机关工人退休后被采取强制措施和受行政、刑事处罚的，如已参加养老保险并按养老保险有关规定计发基本养老金，其待遇处理办法按国家有关养老保险的规定执行。
事业单位科长是在2018年办理退休的，机关事业单位的养老保险制度是从2014年10月1日开始执行的，由于2018年的退休的机关事业单位工作人员，包括工人在内，都是缴纳的机关事业单位养老保险，养老金的计算办法是按照新老办法对比计算执行的，总体上是按照新办法计算的结果执行。
退休后不管是因为什么原因被判处三年有期徒刑，对于退休人员虽然不再给予具体的行政处分，但如果符合开除处分条件的，会取消退休待遇。养老保险制度实施以后，事业单位科长的养老金，分为基本养老金和职业年金两个部分。
在基本养老金计算中，基础养老金和过渡性养老金，都涉及到缴费年限的问题。事业单位科长是在2018年办理退休，实际缴费年限只有4年，大部分年限为视同缴费年限。判处有期徒刑后，以前的视同缴费年限全部被取消，余下的四年缴费年限，根本达不到办理退休的标准。
其中过渡性养老金是完全按照视同缴费年限来计算的，过渡性养老金占基本养老金的比重是比较大的，有的人还要超过基础养老金，视同缴费年限清零以后，以前计算的基础养老金、过渡性养老金也就清零了，只剩下个人账户养老金和职业年金。
个人账户由于只缴纳了4年左右，划入个人账户的就是本人缴纳的8%，所以个人账户余额是不高的，估计也就是几万元钱，这个部分在刑满释放以后，是要退还给本人的；另外还有几年的职业年金，职业年金个人账户包括了单位缴费和个人缴费部分，如果单位缴费部分因为判刑的原因，不再划入个人账户，那个人账户划入就只有自己缴纳的4%。
综上所述，事业单位的科长，2018年办理退休，退休后被判处三年有期徒刑，刑满释放以后退休金是没有了，至于是不是有生活费，这需要由原单位酌情考虑。在养老保险制度实施以后，按照养老保险规定领取养老金的，由于视同缴费年限清零以后，已经不符合办理退休的条件无法重新办理退休，但养老保险个人账户和职业年金个人账户资金是可以退还的。
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